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Proteomik
Als Proteomik wird die Gesamtheit aller in einem Lebewesen, Gewebe, Zelle oder Zellkompartiment befindlichen Proteine zu einem bestimmten Zeitpunkt unter definierten Bedingungen bezeichnet. Das Proteom ist einer immer fortwährenden Änderung ausgesetzt, da Proteine ständig neu synthetisiert bzw. abgebaut werden. Bei der Proteomik-Analytik geht es deshalb hauptsächlich um die Probenvorbereitung und Trennung von Proteinen, Enzymen, Peptiden und Amino-Säuren. Ferner ist darin z.T. auch die RNA- und DNA-Analytik mit inbegriffen.
Zur Probenvorbereitung zählen vor allem die Proteinextraktion (Protein Extraction), Peptid-Aufreinigung (Peptide Purification) und die Phosphopeptid-Anreicherung.
Für die Analytik von Proteinen und Peptiden stehen eine Reihe von chromatographischen Trennmethoden zur Verfügung. So z.B. die Reversed-Phase-Chromatographie, die hydrophile sowie die hydrophobe Interaktionschromatographie (HILIC bzw. HIC), die Ionenaustauschchromatographie (IEX), die Größenausschlusschromatographie (SEC) und die Affinitätschromatographie (AFC).
Im Folgenden finden Sie detailliertere Informationen mit Applikationsbeispielen zur Analyse bestimmter Proteine, Peptide, DNA, RNA, Antikörper, Aminosäuren usw.
Technische Daten
Top-Down versus Bottom-Up Ansatz
Bei der Analyse von Proteomiks spielen eine Vielzahl von Proteinen und Peptiden eine wichtige Rolle. Für die Detektion dieser Analyten wird häufig die Massenspektrometrie (MS) verwendet. Dabei gibt es zwei verschiedene Ansätze für die MS Analyse von Proteomiks: Top-Down und Bottom-Up.
Top-Down wird verwendet, um intakte Proteine durch ESI-MS (Electron Spray Ionization) in der Gasphase zu untersuchen und zu fragmentieren. Dabei können die Vielzahl an verschiedenen Ladungsvarianten der Proteine zu komplizierten Spektren führen. Die Flüssigchromatographie kann bei der Trennung komplexer Proben helfen, bevor diese durch ESI-MS detektiert werden. Durch den Top-Down Ansatz können Abbauprodukte und Sequenzvarianten erkannt werden, welche bei der Lösung von Interferenzproblemen und der Bestimmung von posttranslationalen Modifikationen helfen.
Bottom-Up beschreibt den Ansatz, bei dem die Proteine zunächst enzymatisch gespalten werden (auch Digestion - Verdauung genannt, häufig Tryptic Digest). Die dabei entstehenden Peptide können dann Massenspektrometrisch untersucht werden. Dabei können einzelne Proteine oder eine Mischung aus Proteinen gespalten werden. Durch diese enzymatische Spaltung werden tausende bis hunderttausende Peptide erhalten, weshalb ein zweidimensionaler Ansatz hilfreich sein kann. Die ursprünglichen Proteine können im Anschluss durch Vergleiche mit theoretischen Peptid Massen oder einer Datenbank identifiziert werden.
Downloads
Hersteller Übersicht
AMT
Proteine:
- HALO 1000Å Protein
- HALO 400Å Protein
Peptide:
- HALO 160Å Peptide
Glycan:
- HALO Glycan
- AMT HALO Bioclass Brochure
- AMT HALO Analysis of proteins
- AMT HALO 1.5mm Column 1000Å C4 Sensitivity Increase of Mixed Proteins Application
- AMT HALO 2 MZ-Apps Peptides & Proteins ES-C18 Lot Reproducibility Application
- AMT HALO MZ-Apps Rp HALO 400Å C4 Protein Columns
- AMT HALO Fast Peptide Separation with HALO 2 Peptide ES-C18 Application
- AMT HALO 2 ES C18 Peptide High Temperature Low pH Stability Application
- AMT HALO 2 ES C18 Peptide Peak Capacity Application
- AMT HALO 2 MZ-Apps Peptides & Proteins ES-C18 Lot Reproducibility Application
- AMT-HALO® Separation of PNGase-Released & Labeled N-Glycans
- AMT-HALO® Separation of Procainamide-Labeled Dextran Standards
- AMT HALO MZ-Apps HALO-Glycan Information Sheet
Concise Separations
Aminosäuren:
- AMINOSep
- Amino Acid
RNA:
- RiboSep
GL Sciences
Probenvorbereitung - Tryptic Digest:
- MonoTip Trypsin
Probenvorbereitung - Entsalzung und Anreicherung:
- MonoTip C18
Probenvorbereitung - Phosphopeptid Anreicherung:
- Titansphere
- Titansphere Phos-TiO Kit
- Titansphere Phos-TiO MP Kit
- Titansphere Phos-TiO für große Proben
Probenvorbereitung - Entsalzung von Phosphopeptiden:
- GL-Tip SDB
- GL-Tip GC
- MonoTip TiO
Probenvorbereitung - Entferrnung von Phosphopeptiden:
- MonoSpin Phospholipid
Probenvorbereitung - Aufreinigung und Anreicherung kleiner Proben:
- MonoSpin Series
Probenvorbereitung - Peptid Fraktionierung:
- GL-Tip SCX
- GL-Tip SDB-SCX
Probenvorbereitung - Antikörper Aufreinigung:
- MonoSpin ProA
- MonoSpin ProG
Proteomik - Reversed Phase:
- MonoCap C18
- ProteoSil 300-C18
- ProteoSil 300-C8
- ProteoSil 200-C18
- ProteoSil 100-C18
- ProteoSil 300-C4
- MonoSelect RP-mAb
Proteomik - HILIC:
- MonoCap HILIC
- ProteoSil HILIC
Proteomik - SEC:
- ProteoSil 300-SEC
- ProteoSil 100-SEC
Proteomik - IEX:
- MonoCap SCX
Proteine und Peptide - Reversed Phase:
- Inertsil WP300 C18
Proteine - SEC:
- Inertsil WP300 Diol
- GL Sciences Bio General Catalogue
- GL Sciences Bioanalysis Catalogue
- GL-Sciences ProteoSil - MonoSelect Bioseparation Solution Bio LC Columns
- GL-Sciences Inertsil WP300 C18 Analysis of Peptides and Proteins Applications
- GL-Sciences Inertsil WP300 Diol Analysis of Protein Applications
- GL-Sciences ProteoSil Applications
Imtakt
Aminosäuren:
- Intrada Amino Acid
- Imtakt Biochemicals and Metabolites Applications
- Imtakt Intrada Amino Acid 55 Amino acids Standard Applications
- Imtakt Intrada Amino Acid Amino Acids in Soy Source Applications
- Imtakt Intrada Amino Acid Amino Acids Standard (Agilent) Applications
- Imtakt Intrada Amino Acid Amino Acids Standard (Shimadzu) Applications
- Imtakt Nucleic Acids and Related Compounds Applications
- Imtakt Peptides, Proteins and Amino Acids Applications
Sepax
Proteine, Peptide und Antikörper - SEC:
- SRT
- Unix
- Zenix
- Nanofilm
Antikörper - IEX:
- Antibodix
Antikörper - Affinitätschromatographie:
- ProAqa Excel
- Affinity HSA
- Polar MC-IMAC Excel (Metall Affinität)
Proteomik - IEX:
- Proteomix
Proteomik - Reversed Phase:
- PolyRP
Proteomik - HIC:
- Proteomix HIC
mRNA - Affinitätschromatographie:
- Monomix dT20 Affinity
Adeno-associated Viruses - IEX:
- Proteomix AAV SAX
- Sepax Unix-P1002 SEC-1.8um Application Notes
- Sepax Complex Protein Sample Mixtures Analysis
- Sepax Fusion Protein Separation on SEC & SAX
- Sepax Antibodix NP10 Analysis of MAb with Charge Variance
- Sepax Antibodix NP10 Analysis of MAb-X22 Impact of Initial Salt
- Sepax Antibodix NP10 Analysis of MAb-X22 Impact of Mobile Phase Ph
- Sepax Antibodix WCX-NP3 Analysis of MAb
- Sepax Antibodix WCX-NP5 Proteomix SCX-NP5 Ion Exchange Kit for MAb-separation
- Sepax Glycomix SAX Analysis of Heparin & Heparin-like Impurities
- Sepax Glycomix SAX Zenix SEC SRT SEC-Heparin Analysis
- Sepax Mabpurix Protein-A Affinity Chromatography Resins & Columns for MAb Purification
- Sepax Nanofilm SEC SRT-C Membran Protein Separation
- Sepax Proteomix HIC-Butyl-1.7 Intact & Oxidized MAb Analysis
- Sepax Proteomix HIC-Butyl-NP5 Erbitux & Rituximab MAb Separation
- Sepax Proteomix RP-1000 Column Temperature-Effect-on-MAb Separation
- Sepax Proteomix RP-1000 Proteomix RP-500 MAb Fragment
- Sepax Proteomix SAX-NP10 Analysis of Glycoprotein
- Sepax Proteomix SAX Fast Analysis of N-Linked Sialylated Glycan
- Sepax Proteomix SAX Intact Glycoprotein Isoforms Separation
- Sepax Proteomix SCX-NP5 MAb Characterization
- Sepax Proteomix SCX-NP5 MAb-IgG1 & IgG2 Charge Variants Separation
- Sepax Proteomix SRT-SEC Zenix-C Zenix Complex Protein Sample Mixtures Analysis
- Sepax SRT-C 300 Analysis of MAb SEC
- MAb Purification on SRT-10 300
- Sepax SRT-300 Separation of Monoclonal Antibody
- Sepax Unix-C SEC-300 MAb Separation
- Sepax Unix SEC-300 1.8 Biomolecule Separation
- Sepax Zenix-C SEC-300 Rituximab Analysis
- Sepax Zenix-C SEC Analysis of Insulin and HMW Aggregates
- Sepax Zenix SEC-300 Zenix-C SEC-300 Proteomix SAX-Np5 Fusion Protein Separation
- Sepax Zenix SEC-300 Zenix-C SEC-300 SEC Screening Kit
- Sepax Zenix SEC and Proteomix Fusion Protein Separation on SEC and SAX
- sepax_sec_screening_kit
Shodex
Proteine und Peptide - SEC:
- Protein KW
- Protein LW
Proteine und Peptide - Reversed Phase:
- RSpak DE
- Asahipak ODP-50
Proteine und Peptide - HILIC:
- HILICpak VC-50
- Asahipak NH2P
Proteine und Peptide - IEX:
- IEC QA-825
- IEC DEAE-825
- IEC SP-825
- IEC SP-FT 4A
- IEC CM-825
- IEC ES-502C 7C
Proteine und Peptide - Mixed-Mode:
- Asahipak GS-220 HQ
- Asahipak GS-320 HQ
Aminosäuren - IEX:
- RSpak NN-814
- IC YS-50
- CXpak P-421
Aminosäuren - Reversed Phase:
- Asahipak ODP-50
Aminosäuren - HILIC:
- HILICpak VC-50
- HILICpak VG-50
- Asahipak NH2P
Nucleotide - Mixed-Mode:
- Asahipak GS-320 HQ
- RSpak NN-814
Nucleotide - Reversed Phase:
- RSpak DE
Oligonucleotide - HILIC:
- HILICpak VN-50
DNA/RNA - IEX:
- IEC DEAE-825
DNA/RNA - SEC:
- OHpak SB
- OHpak LB
- Asahipak GF-510 HQ
- Asahipak GF-M0 HQ
- Shodex HPLC Columns Catalog 2023-2024
- Shodex Asahipak C8P-50 4D High Molecular Weight Peptides Applications
- Shodex OHpak LB-806M Absolute Molecular Weight Determination of Heparin Applications
- Shodex OHpak SB-804 HQ Heparin Applications
- Shodex OHpak SB-806M HQ Heparin Applications
- Shodex PROTEIN KW-802.5 Analysis of Insulin Human According to JP Method Applications
- Shodex PROTEIN KW-802.5 Analysis of Insulin According to USP Method Applications
- Shodex PROTEIN LW-803 Comparison if SEC Separation of mAb Applications
Thermo
Peptide - Reversed Phase:
- Accucore 150-C18
Proteine - Reversed Phase:
- Accucore 150-C4
- ProSwift RP
- PepSwift
Proteine - HIC:
- MAbPAC HIC Series
- ProPac HIC
Proteine - Ladungsvarianten mit IEX:
- ProPac Elite WCX
- ProPac SAX-1
- MAbPac SCX
- ProPac 3R IEX
Antikörper - Affinitätschromatographie:
- MAbPAC Protein A
Antikörper - SEC:
- MAbPac SEC-1
- Acclaim SEC-300
- Acclaim SEC-1000
Antikörper - Reversed Phase:
- MAbPac RP (Top-Down)
- BioBasic C4
Antikörper - IEX:
- ProPac Elite WCX
Glycane - HILIC:
- Accucore 150-Amide-HILIC
Glycane - Mixed-Mode:
- GlycanPac AXH-1
- GlycanPac AXR-1
Peptid Mapping - Reversed Phase:
- Hypersil GOLD VANQUISH C18
- Hypersil GOLD Peptide
- PepMap (Bottom-Up)
- µPAC (Bottom-Up)
Nucleinsäuren und Oligonucleotide - Reversed Phase:
- DNAPac RP
Oligonucleotide - IEX:
- DNAPac PA200
- DNASwift SAX-1S
- DNAPac RP
Proteine und Peptide - Metallaffinität:
- ProPac IMAC-10
Probenvorbereitung - Digestion:
- SMART Digest
Proteine - IC:
- Dionex CarboPac PA20
- Dionex IonPac AS11-HC
- Thermo Accucore HPLC Columns for Biomolecule Separations HPLC Life Science Brochure
- Thermo BioLC Columns Consumables HPLC Life Science Brochure 2022-23
- Thermo CX-1 LC Gradient Buffers HPLC Brochure
- Thermo Dnapac Superior Oligonucleotide Analysis HPLC Life Science Brochure
- Thermo Glycanpac AXH-1 HPLC Life Science Brochure
- Thermo Glycanpac AXR-1 HPLC Life Science Brochure
- Thermo Hypersil GOLD Peptide Brochure
- Thermo Low Flow Columns Accessories HPLC UHPLC Life Science Brochure
- Thermo MAbPac HIC HPLC Life Science Brochure
- Thermo MAbPac Protein A HPLC Life Science Brochure
- Thermo MAbPac RP HPLC Life Science Brochure
- Thermo MAbPac SCX 10 HPLC Life Science Brochure
- Thermo MAbPac SEC 1 SEC Life Science Brochure
- Thermo PepSwift ProSwift HPLC Brochure
- Thermo ProPac 3R Brochure
- Thermo ProPac IMAC 10 HPLC Life Science Brochure
- Thermo ProPac Elite WCX HPLC Life Science Brochure
- Thermo ProPac HIC 10 HPLC Life Science Brochure
- Thermo ProSwift RP HPLC Life Science Brochure
- Thermo Smart Digest Protein Digestion Life Science Brochure
- Separation of Peptides Using a Core Enhanced Technology Accucore HPLC Column
- Thermo BioBasic Characterization of mAb and ADCs Application
- Thermo Dionex Carbopac PA20 Organic Impurities in Heparin by HPAE-PAD HPLC Life Science Applications
- Thermo Dionex IonPac AS11 HC Determining of OSCS in Heparin HPLC Life Science Applications
- Thermo DNAPac RP LC-HRMS mRNA Direct Sequence Mapping HPLC Life Science Applications
- Thermo Hypersil GOLD Peptide for Reliable Monitoring of Glycopeptide Variants in mAb
- Thermo Hypersil GOLD Peptide Performance Comparison of RP C18 Columns for Peptide Mapping
- Protein A Affinity Column for Monoclonal Antibody (MAb) Titer Analysis
- Thermo MAbPac SCX Application of Salt and pH Based Ion Exchange Chromatography Gradients HPLC Life Science Applications
- Thermo Propac 3R SAX Salt Gradient AAV Analysis Application
- Thermo Propac 3R SAX Salt Gradient Protein G Analysis Application
- Thermo ProPac 3R SCX pH Gradient mAb Analysis Application
- Thermo ProPac 3R SCX Salt Gradient mAb Analysis Application
- Thermo Propac Elite WCX pH Gradient Analysis of IgG1 HPLC Life Science Applications
- Thermo Propac Elite WCX Therapeutic Protein Analysis HPLC Life Science Applications
- Thermo Bottom-Up Proteomic Profiling with µPAC HPLC Columns
- Thermo High Throughput, Routine and Comprehensive Proteome Analysis using µPAC HPLC Columns
- Thermo Oligonucleotide Characterization using µPAC Columns
- Thermo Peptide Separation on µPAC HPLC Columns
- Thermo Routine Proteome Analysis using 50 cm µPAC Columns
Tosoh
Proteine und Peptide - SEC:
- TSKgel SW
- TSKgel SWXL
- TSKgel SuperSW
- TSKgel UltraSW
- TSKgel UP-SW
Aminosäuren - IEX:
- TSKgel SAX
- TSKgel SCX
Peptide und kleine Proteine - IEX:
- TSKgel Q-STAT
- TSKgel SP-STAT
- TSKgel CM-STAT
- TSKgel SCX
- TSKgel SP-2SW
- TSKgel CM-2SW
- TSKgel DEAE-2SW
Peptide - HIC:
- TSKgel Butyl-NPR
Proteine - IEX:
- TSKgel BioAssist S
- TSKgel BioAssist Q
- TSKgel Q-STAT
- TSKgel SP-5PW
- TSKgel DEAE-5PW
- TSKgel CM-5PW
- TSKgel SP-STAT
- TSKgel CM-STAT
- TSKgel SP-NPR
- TSKgel DEAE-NPR
- TSKgel SuperQ-5PW
Proteine - HIC:
- TSKgel Phenyl-5PW
- TSKgel Ether-5PW
- TSKgel Butyl-NPR
Proteine - Reversed Phase:
- TSKgel Protein C4-300
- TSKgel TMS-250
Nucleoside - IEX:
- TSKgel SP-2SW
- TSKgel DEAE-2SW
Nucleotide - IEX:
- TSKgel Q-/DNA-STAT
- TSKgel DEAE-2SW
Peptide, Oligonucleotide, Nukleinbasen - HILIC:
- TSKgel Amide-80
Oligonucleotide - IEX:
- TSKgel Q-/DNA-STAT
- TSKgel DEAE-5PW
- TSKgel DEAE-NPR
- TSKgel DNA-NPR
- TSKgel SuperQ-5PW
Oligonucleotide und DNA/RNA - HIC:
- TSKgel Phenyl-5PW
- TSKgel Butyl-NPR
Oligonucleotide und DNA/RNA - Reversed Phase:
- TSKgel Oligo-DNA RP
DNA/RNA - IEX:
- TSKgel Q-/DNA STAT
- TSKgel DNA-NPR
- TSKgel DEAE-NPR
- TSKgel DEAE-5PW
- TSKgel DEAE-3SW
Antikörper - Affinitätschromatographie:
- TSKgel FcR-IIIA-NPR
- TSKgel Protein A-5PW
- Tosoh Chromatography Catalogue 2019
- Tosoh Assessing the Heterogeneity of the Fc-Glycan of a Therapeutic Antibody Using an engineered FcγReceptor IIIa-Immobilized Column Applications
- Tosoh SkillPak Development and scale-up of an antibody platform
- Tosoh TOYOPEARL AF-rProtein A HC-650F Improve Performance of the Protein A Capturing Step Applications
- Tosoh TOYOPEARL AR-rProtein A HC-650F Protein A chromatography - The process economics driver in mab manufacturing Applications
- Tosoh TOYOPEARL AR-rProtein A Increased productivity for downstream processin of biotherapeutics Applications
- TOSOH Comparison of Toyopearl AF-rProtein a HC-650F binding capacity at various bed heights and constant linear velocity
- Tosoh TSKgel Amide-80 Glycosilation Analysis Applications
- Tosoh TSKgel Amide-80 N-Glyco Mapping of the ZP-domain of Murine TGFR-3 Applications
- Tosoh TSKgel Amide-80 Separation of Peptides by HILIC Applications
- Tosoh TSKgel Butyl-NPR TSKgel G3000SWXL mAb Aggregate Detection Applications
- Tosoh TSKgel DEAE-5PW Separation of Membrane Protein by IEX Applications
- Tosoh TSKgel Ether-5PW Separation of Membrane Protein by HIC Applications
- Tosoh TSKgel FcR-IIIA-NPR Characterization by Top Down MS Applications
- Tosoh TSKgel G2000SWXL Separation of Low Molecular Mass Heparin by SEC Applications
- Tosoh TSKgel G3000SWXL Analysis of mAb and Proteins Applications
- Tosoh TSKgel G3000SWXL SEC-UV-RI-MALS Analysis of Protein Aggregates Applications
- Tosoh TSKgel G3000SWXL TSKgel SuperSW mAb HR TSKgel SuperSW mAb HTP High Speed and Resolution SEC Analysis of mAbs Applications
- Tosoh TSKgel G3000SW Separation of Membrane Protein by SEC Applications
- Tosoh TSKgel Octadecyl-NPR TSKgel Octadecyl-4PW Separation of Standard Proteins by RPC Applications
- Tosoh TSKgel Protein A-5PW Fast mAb Titer Determination Applications
- Tosoh TSKgel Protein A-5PW Reproducible and Robust Antibody Titer Analysis Applications
- Tosoh TSKgel Protein C4-300 RP Analysis of Antibody Fragments Applications
- Tosoh TSKgel SP-STAT TSKgel CM-STAT Fast Analysis of IgG Charge Heterogeneity Applications
- Tosoh TSKgel SuperSW mAb HR Separation of mAb Monomer from its Half-body Applications
- Tosoh TSKgel SuperSW2000 Separation of Mixture of Proteins and Peptides Applications
- Tosoh TSKgel UP-SW3000-LS SEC-MALS of Antibody Therapeutics Applications
- Tosoh TSKgel UP-SW3000 UHPLC Analysis of Immunoglobulins Applications
- Tosoh TSKgel UP-SW3000 Inceased Monoclonal Antibody Resolution Applications
Waters
Peptide - UHPLC - Reversed Phase:
- Acquity UPLC Peptide CSH C18, 1.7µm
- Acquity Premier Peptide CSH C18, 1.7µm
- Acquity UPLC Peptide HSS T3, 1.8µm
- Acquity Premier Peptide HSS T3, 1.8µm
- Acquity UPLC Peptide BEH C18, 1.7µm
- Acquity Premier Peptide BEH C18, 1.7µm
- XSelect Peptide CSH C18, 2.5µm
- XSelect Premier Peptide CSH C18, 2.5µm
- XSelect Peptide HSS T3, 2.5µm
- XSelect Premier Peptide HSS T3, 2.5µm
- nanoEase MZ Peptide BEH C18, 1.7µm
- XBridge Premier Peptide BEH C18, 2.5µm
Peptide - Reversed Phase:
- XBridge Peptide BEH C18, 3.5µm
- BioSuite C18
- Delata-Pak
Peptide/Proteine - IEX:
- Protein-Pak HR Q
- Protein-Pak HR DEAE
- Protein-Pak HR SP
- Protein-Pak HR CM
- BioSuite SP
- BioSuite CM
- BioSuite Q
- BioSuite DEAE
Proteine - Reversed Phase:
- BioResolve RP mAb Polyphenyl, 2.7µm
- BioSuite Phenyl, 10µm
- DeltaPak C4
- Symmetry C4 300, 3.5µm, 5µm
- XBridge Protein BEH C4
Proteine - UHPLC - HILIC:
- ACQUITY Glycoprotein BEH Amide, 1.7µm
Proteine - UHPLC - HIC:
- Protein-Pak Hi Res HIC, 2.5µm
Proteine - HIC:
- Protein-Pak Hi Phenyl, 10µm
Proteine - UHPLC - IEX:
- BioSuite Anion-Exchange, 2.5µm
Proteine - UHPLC - Reversed Phase:
- ACQUITY Protein BEH C4, 1.7µm
- nanoEase MZ Protein BEH C4, 1.7µm
Proteine - UHPLC - SEC:
- ACQUITY Premier Protein SEC
- BioResolve SEC mAb, 2.5µm
- XBridge Premier Protein SEC, 2.5µm
Proteine - SEC:
- BioSuite Diol (OH), 5µm
- Protein-Pak SEC
Die passende Säule für Sie - Gerne beraten wir Sie persönlich
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