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Als Membran Proteine werden Proteine bezeichnet, die mit einer Zellmembran oder Membranen von Zellkompartimenten assoziiert sind. Transmembranproteine durchziehen die Zellmembran vollständig, wobei membranständige Proteine nur an eine Seite der Lipiddoppelschicht angelagert sind.
Membran Proteine können mit allen Trenntechniken der Protein-Analytik untersucht werden. Das sind die Umkehrphasenchromatographie, die hydrophile sowie die hydrophobe Interaktionschromatographie (HILIC bzw. HIC), die Ionenaustauschchromatographie (IEX), die Größenausschlusschromatographie (SEC) und die Affinitätschromatographie (AFC)
Für weiteres Informationsmaterial und Applikationsbeispiele zur Analyse von Proteinen siehe Proteom-Analytik.