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Oligonukleotide

Oligonukleotide sind kurze, synthetisch hergestellte DNA- oder RNA-Sequenzen, die aus wenigen Nukleotiden bestehen. Sie spielen eine wichtige Rolle in der molekularen Biologie und Medizin, insbesondere in der Genforschung, Diagnostik und Therapie. In der Medizin werden Oligonukleotide vor allem als Therapeutika eingesetzt, um spezifische Gene zu beeinflussen. Dazu gehören Antisense-Oligonukleotide, die die Genexpression unterdrücken, und siRNA (small interfering RNA), die gezielt mRNA abbauen, um die Synthese krankheitsverursachender Proteine zu verhindern. Diese Technologien bieten vielversprechende Ansätze zur Behandlung genetischer Erkrankungen, Krebs und viraler Infektionen.

 

Die Analyse von Oligonukleotiden ist von entscheidender Bedeutung, da sie die Qualität, Reinheit und Wirksamkeit dieser Moleküle in biomedizinischen Anwendungen sicherstellt. Präzise Analysen ermöglichen es, Sequenzfehler zu erkennen, die Funktionalität und Stabilität der Oligonukleotide zu überprüfen und sicherzustellen, dass sie die gewünschte biologische Wirkung entfalten. Besonders in der therapeutischen Anwendung, wie bei Antisense-Oligonukleotiden oder siRNA, ist eine genaue Charakterisierung notwendig, um unerwünschte Nebenwirkungen und eine ineffektive Behandlung zu vermeiden. Methoden wie Massenspektrometrie, HPLC und Sequenzierung spielen dabei eine zentrale Rolle.

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Zenix-C SEC-100 3µm 100Å 300x7.8mm HPLC-Säule
SPX-233100-7830
2.221,00 €
Zenix SEC-300 3µm 300Å 300x7.8mm HPLC-Säule
SPX-213300-7830
2.190,00 €
Zenix SEC-150 3µm 150Å 300x7.8mm HPLC-Säule
SPX-213150-7830
2.190,00 €
Sepax Bio-C18 5µm 300Å 250x4.6mm HPLC-Säule
SPX-106185-4625
647,00 €
Sepax GP-C18 1.8µm 120Å 50x2.1mm HPLC-Säule
SPX-101181-2105
656,00 €
Cosmocore® 2.6PBr Packed Column 2.1mmx100mm
NT-13695-91
599,00 €
Cosmocore® 2.6Cholester Packed Column 2.1mmx100mm
NT-12861-31
601,00 €
Cosmocore® 2.6C18 Packed Column 2.1mmx100mm
NT-12614-71
Cosmosil® 3C18-EB Packed Column 2.0mmx100mm
NT-09796-01
Intrada Organic Acid, 150 mm x 2.0 mm LxID, 3um, Intact organic acid LC-MS analysis column
IMT-WOA25F
826,00 €
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Technische Daten

Unterschiede zwischen Nukleotiden, Oligonukleotiden und DNA/RNA

Die Unterschiede zwischen der Oligonukleotid-, Nukleotid- und DNA/RNA-Analyse mittels HPLC liegen in den Zielmolekülen und den Analysemethoden:

 

  • Oligonukleotid-Analyse: Hier werden kurze Ketten von Nukleotiden (Oligonukleotide) analysiert. Oft wird Reversed-Phase HPLC (RP-HPLC) eingesetzt, um verschiedene Oligonukleotide basierend auf ihrer Länge und chemischen Modifikationen zu trennen.
  • Nukleotid-Analyse: Einzelne Nukleotide (ATP, GTP, CTP, UTP etc.) werden analysiert. Hier wird häufig Anionenaustausch-HPLC verwendet, um die Nukleotide anhand ihrer Ladung und Größe zu trennen.
  • DNA/RNA-Analyse: Bei der Analyse von größeren DNA- oder RNA-Molekülen wird HPLC zur Reinheitsprüfung und Quantifizierung genutzt. Spezielle Säulen und Methoden wie Größenausschluss-HPLC oder Affinitätschromatographie können verwendet werden, um intakte Nukleinsäuren oder ihre Fragmente zu trennen.

Applikationen

Oligonukleotid Trennung mit guter Peakform mit AMT HALO Oligo C18

  • Trennung von Oligonukleotiden bis zu 60 Basen (60 mer) bei guter Peakform

Peakidentitäten

1. 10 mer  2. 15 mer  3. 20 mer  4. 25 mer  5. 30 mer  6. 40 mer  7. 50 mer  8. 60 mer  * Tris HCl/EDTA

Säule

AMT: HALO 120Å OLIGO C18, 2.7µm, 50x2.1mm

Competitor: OLIGO 130Å C18, 1.7µm, 50x2.1mm

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Hersteller Übersicht

AMT

HPLC - Reversed Phase:

  • HALO Oligo, 2.7µm

GL Sciences

HPLC - Reversed Phase:

  • ProteoSil 200-C18, 3µm
  • MonoClad C18-HS
  • InertSustainSwift C18, 3µm

 

HPLC - Mixed-Mode:

  • InertSustain AX-C18, 3µm

 

UHPLC - HILIC:

  • InertSustain Amide, 1.9µm

Hamilton

HPLC - Reversed Phase:

  • PRP-C18, 5µm

Imtakt

HPLC - Mixed-Mode:

  • Intrada Organic Acid, 3µm
  • Scherzo SW-C18, 3µm

 

HPLC - Reversed Phase:

  • Unison UK-C18, 3µm
  • Unison US-C18, 5µm

 

UHPLC - Reversed Phase:

  • Presto FF-C18, 2µm

Macherey-Nagel

HPLC - IEX:

  • Nucleogel SAX

 

HPLC - HILIC:

  • Nucleodur HILIC, 5µm

 

HPLC - Reversed Phase:

  • Nucleosil C18, 5µm

Nacalai Tesque

HPLC - Reversed Phase:

  • Cosmosil C18-EB, 3µm
  • Cosmocore PBr, 2.6µm
  • Cosmocore C18, 2.6µm
  • Cosmocore Cholester, 2.6µm

Nouryon - Kromasil

UHPLC - Reversed Phase:

  • Kromasil 100 Phenyl, 2.5µm
  • Kromasil 100 C4, 2.5µm
  • Kromasil 100 C18, 2.5µm

Osaka Soda

UHPLC - Reversed Phase:

  • Capcell PAK C18, IF, 1.8µm

Sepax

HPLC - IEX:

  • Proteomix SAX, 3µm
  • Proteomix SAX, 5µm

 

HPLC - SEC:

  • Zenix SEC-300, 3µm
  • Zenix SEC-150, 3µm
  • Zenix-C SEC-150, 3µm
  • Zenix-C SEC-100, 3µm

 

HPLC - Reversed Phase:

  • Bio-C18, 5µm

 

UHPLC - Reversed Phase:

  • GP-C18, 1.8µm

Shimadzu

UHPLC - Reversed Phase:

  • Shim-pack Scepter Claris C18, 1.9µm
  • Shim-pack Scepter C18, 1.9µm
  • Shim-pack Scepter HD-C18, 1.9µm

 

HPLC - Reversed Phase:

  • Shim-pack Scepter C18, 5µm

 

HPLC - IEX:

  • Shim-pack Bio IEX Q-NP, 5µm

Shodex

HPLC - HILIC:

  • HILICpak VN-50 1D
  • HILICpak VN-50 2D

Thermo

HPLC - Reversed Phase:

  • DNAPac RP, 4µm

Tosoh

HPLC - IEX:

  • TSKgel DEAE-3SW, 10µm

Waters

UHPLC - Reversed Phase:

  • ACQUITY UPLC Oligonucleotide BEH C18, 1.7µm
  • ACQUITY Premier Oligonucleotide BEH C18, 1.7µm
  • ACQUITY Premier CSH, 1.7µm
  • XBridge Oligonucleotide BEH C18, 2.5µm
  • XTerra MS C18, 2.5µm

 

Probenvorbereitung:

  • OASIS HLB SPE

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