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Mittelpolare Phasen werden die stationäre Phasen bezeichnet, deren Polarität zwischen unmodifizierten und Alkyl-gebundenen Silika-Gel liegt. Es handelt sich dabei meist um speziell modifizierte Silika-Gele, deren Selektivität gezielt ausgenutzt werden kann. Die bekanntesten mittelpolaren Phasen sind Cyano‒, Diol‒, Amino‒ und Nitrophasen, wobei Nitrophasen in den letzten Jahren fast gänzlich vom Markt verdrängt wurden und kaum noch erhältlich sind. Ein großer Vorteil dieser Phasen ist, dass sie sich sowohl für die Normalphasen‒ als auch für die Umkehrphasenchromatographie verwenden lassen.