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Die Ionenaustauschchromatographie (IEX) dient der Trennung und Analyse von geladenen bzw. ionisierbaren Molekülen. Es wird zwischen Anionen- und Kationenaustauscher unterschieden, des Weiteren zwischen starken und schwachen Austauschern.
WCX: schwacher Kationaustauscher (Weak Cation Exchanger)
Die Ionenaustauschchromatographie wird häufig als Biotrenntechnik für Proteine und Antikörper verwendet. Proteine werden dabei nach ihrer Netto- oder Oberflächenladung getrennt, die abhängig ist von dem pH-Wert und der Ionenstärke der mobilen Phase. Weitere Anwendungsgebiete sind Oligonucleotide, Zucker, RNA- und DNA-Moleküle und weiteres mehr.
Die Ionenchromatographie und die Ionenausschlusschromatographie sind zwei Spezialfälle der Ionenaustauschchromatographie mit eigenen Säulentechnologien für spezifische Anwendungen.